Samordningen foregår på alle plan i forvaltningen og på alle nivå i departementene, og er samtidig en av de viktigste oppgavene til regjeringskollegiet. Men dersom alle viktige saker som angår to eller flere departement alltid skulle avgjøres av en samlet regjering, ville det bety en veldig arbeidsmessig belastning for kollegiet. Regjeringen prøver derfor ofte å begrense kretsen av statsråder til de som er mest berørt. Av samme grunn er det nedsatt permanente regjeringsutvalg som har til oppgave å samordne de enkelte departements tiltak. Eksempelvis er det egne regjeringsutvalg for å samordne tiltak vedrørende forskning og landets sikkerhet.

Samordningen i departementene skjer også ved at det opprettes departementale eller interdepartementale arbeidsgrupper, eller ved at det nedsettes offentlige utvalg.